Per monitorare e verificare l'assolvimento dell'obbligo sono stati istituiti i Certificati di Immissione in Consumo (CIC) che vengono rilasciati dal GSE ai soggetti che immettono i biocarburanti sostenibili nel sistema di distribuzione nazionale, oltre che ai produttori di Biometano.

Ogni singolo CIC attesta l'immissione in consumo di un quantitativo di biocarburanti pari a 10 Gcal e nel caso di immissione in consumo di biocarburanti avanzati, il singolo certificato attesta l'immissione in consumo di un quantitativo di biocarburanti pari a 5 Gcal. 

A valle del pagamento degli oneri di gestione del sistema d'obbligo, ai Soggetti obbligati sono rilasciati i CIC spettanti sulla base dei quantitativi di biocarburante sostenibile immesso in consumo.

I CIC riferiti ai biocarburanti avanzati diversi dal biometano sono rilasciati ai Soggetti obbligati solo se detti biocarburanti non sono già stati incentivati ai Produttori secondo quanto previsto dal D.M. 2 marzo 2018.

​ ​