La Tariffa Omnicomprensiva (TO), prevista dal DM 18 dicembre 2008, è erogata sull'energia prodotta netta e immessa in rete, prevede il riconoscimento della componente incentivante e della componente derivante dalla vendita dell'energia sul mercato da parte del GSE (cosiddetto “ritiro dell'energia").  

La TO è riconosciuta ai Soggetti responsabili degli impianti qualificati IAFR, a seguito della sottoscrizione di una Convenzione con il GSE. Per la determinazione del valore della tariffa spettante il GSE utilizza esclusivamente le misure trasmesse mensilmente dai gestori di rete e calcola il corrispettivo spettante applicando una formula che tiene in considerazione questi tre elementi:

1. l'energia immessa in rete dall'impianto “Er";
2. l'energia incentivata “Ei" determinata sulla base della tipologia di intervento realizzato sull'impianto. Sono tenuti in considerazione i diversi tipi di intervento (nuova costruzione, riattivazione, potenziamento, rifacimento  totale o parziale) in quanto alcune tipologie di intervento danno diritto all'incentivazione di tutta l'energia  immessa in rete “Er", altre tipologie solo di parte;
3. la tariffa incentivante omnicomprensiva. 

Il Conguaglio consiste nella chiusura della partita commerciale relativa all'anno di produzione oggetto di analisi ed è necessario per:

• la corretta quantificazione della percentuale di energia incentivabile rispetto al totale di energia prodotta;
• la verifica del mantenimento dei requisiti di ottenimento della qualifica IAFR;
• il controllo del rispetto dei vincoli normativi previsti (ad esempio per l'utilizzo di particolari combustibili).

Il Conguaglio viene effettuato solo per gli impianti termoelettrici e idroelettrici dotati di sistemi di pompaggio e viene calcolato acquisendo dati sotto forma di dichiarazioni - rese ai sensi del D.P.R. 445/2000 - di cui il GSE ha la facoltà di verificare la veridicità. La mancata richiesta del Conguaglio può comportare la sospensione dell'erogazione degli incentivi.

Per gli impianti termoelettrici che utilizzano Olii Vegetali Puri tracciati (OVP) o Sottoprodotti di Origine Animale (SOA) è previsto il riconoscimento di una tariffa maggiorata. Tale riconoscimento può avvenire in acconto, durante l'anno, o a conguaglio nell'anno successivo a quello di produzione dell'energia elettrica, in ogni caso sempre a valle della presentazione, da parte del produttore, della documentazione specifica.